Гэтыя антымікробныя пептыды першапачаткова былі атрыманы з ахоўных сістэм насякомых, млекакормячых, земнаводных і г.д., і ў асноўным яны ўключаюць у сябе чатыры катэгорыі:
1. Цэкропін першапачаткова прысутнічаў у імуннай лімфе Cecropiamoth, якая ў асноўным сустракаецца ў іншых насякомых, і падобныя бактэрыцыдныя пептыды таксама знойдзены ў кішачніку свіней.Звычайна яны характарызуюцца моцна шчолачным N-канцавым рэгіёнам, за якім варта доўгі гідрафобны фрагмент.
2. Антымікробныя пептыды Xenopus (magainin) атрымліваюць з цягліц і страўніка жаб.Структура антымікробных пептыдаў ксенопуса таксама аказалася спіральнай, асабліва ў гідрафобных асяроддзях.Канфігурацыю антыпептыдаў ксенопуса ў ліпідных слаях даследавалі з дапамогай N-пазначаных цвёрдафазных ЯМР.Зыходзячы з хімічнага зруху ацыламінавага рэзанансу, спіралі антыпептыдаў ксенопуса былі паралельнымі двухслаёвымі паверхнямі, і яны маглі збліжацца, утвараючы 13-міліметровую клетку з перыядычнай спіральнай структурай 30 мм.
3. дефензин. Абарончыя пептыды атрымліваюць з палімакрафагаў полімакрафагаў полікарыятычных нейтрофілаў чалавека з поўнай ядзернай дзелькай і клеткамі кішачніка жывёл.Група антымікробных пептыдаў, падобных на ахоўныя пептыды млекакормячых, была вынятая з насякомых, якія называюцца «ахоўнымі пептыдамі насякомых».У адрозненне ад ахоўных пептыдаў млекакормячых, ахоўныя пептыды насякомых актыўныя толькі супраць грамположительных бактэрый.Нават пептыды абароны ад насякомых утрымліваюць шэсць астаткаў Cys, але метад дысульфіднай сувязі адзін з адным адрозніваецца.Рэжым звязвання ўнутрымалекулярнага дысульфіднага мастка антыбактэрыйных пептыдаў, выцягнутых з дразафілы меланагаст, быў падобны на рэжым звязвання абарончых пептыдаў раслін.У крышталічных умовах ахоўныя пептыды прадстаўлены ў выглядзе дымераў.
4. Тахіплесін атрымліваюць з падковападобных крабаў, якія называюцца падковападобнымі.Даследаванні канфігурацыі паказваюць, што ён прымае антыпаралельную канфігурацыю B-складання (3-8 пазіцый, 11-16 пазіцый), у якойβ-кут злучаны адзін з адным (пазіцыі 8-11), і дзве дысульфідныя сувязі ўтвараюцца паміж пазіцыямі 7 і 12 і паміж пазіцыямі 3 і 16.У гэтай структуры гідрафобная амінакіслата размешчана з аднаго боку плоскасці, а шэсць катыённых астаткаў з'яўляюцца ў хвасце малекулы, таму структура таксама біяфільная.
З гэтага вынікае, што амаль усе антымікробныя пептыды з'яўляюцца катыённымі па прыродзе, нават калі яны адрозніваюцца па даўжыні і вышыні;На высокім узроўні, няхай гэта будзе ў форме альфа-спіралі абоβ-складкавасць, бітропная структура - агульная рыса.
Час публікацыі: 20 красавіка 2023 г